Le jeu suit les exploits de Shinbu et de sa disciple Suirin, deux guerriers du monde imaginaire de Eastern Seiryu cherchant à apprendre l'art du sabre et à reformer leur clan. Pour atteindre ses nobles objectifs, notre duo doit partir à la recherche de plus de 150 techniques (dont la description est gravée sur des marque-pages en bois nommés "kenpu"). Vous pourrez les associer librement pour créer des centaines de "parchemins" de combos différents.
Le monde de cette quête épique est divisé en cinq univers : Suzaku, Byakko, Genbu, Seiryu et Kirin. Ces derniers s'inspirent des constellations découvertes par des astronomes chinois de l'antiquité. Ceux-ci pensaient que le ciel se divisait en quatre quadrants représentant chacun une saison. Pour le printemps, Seiryu, le dragon bleu de l'est. Pour l'été, Suzaku, l'oiseau rouge du sud. Pour l'automne, Byakko, le tigre blanc de l'ouest. Et pour l'hiver, Genbu, la tortue noire du nord. Qui a dit qu'on n'apprenait rien avec les jeux vidéo ?
Pour chaque univers terminé, Shinbu et Suirin gagneront un "art Chi" unique. Pour activer cette attaque dévastatrice, vous devrez avoir accumulé suffisamment de Chi (énergie vitale).
C'est en testant vos propres combos sur d'autres joueurs de Key of Heaven que vous prendrez vraiment votre pied. Le mode ad hoc vous permettra d'affronter vos rivaux pour savoir qui est le meilleur combattant, mais également d'échanger des techniques que vous n'avez pas encore découvertes. Le mode infrastructure mérite également le détour, avec des objets et actions rares que vous pouvez télécharger grâce à des mots de passe spéciaux.